MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus casei BD-II plasmid pBD-II

Total Repeats: 912

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017476	CCT	2	6	421	426	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385824841
2	NC_017476	ATG	2	6	802	807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385824842
3	NC_017476	TGC	3	9	850	858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385824842
4	NC_017476	T	7	7	861	867	0 %	100 %	0 %	0 %	385824842
5	NC_017476	ACC	2	6	944	949	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385824842
6	NC_017476	GTT	2	6	1003	1008	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385824842
7	NC_017476	TG	3	6	1094	1099	0 %	50 %	50 %	0 %	385824842
8	NC_017476	CTGC	2	8	1233	1240	0 %	25 %	25 %	50 %	385824842
9	NC_017476	GCA	2	6	1244	1249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385824842
10	NC_017476	AAAT	2	8	1427	1434	75 %	25 %	0 %	0 %	385824842
11	NC_017476	ACGTG	2	10	1482	1491	20 %	20 %	40 %	20 %	385824842
12	NC_017476	TTG	2	6	1732	1737	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385824842
13	NC_017476	CGT	2	6	1792	1797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385824842
14	NC_017476	GCTC	2	8	1883	1890	0 %	25 %	25 %	50 %	385824842
15	NC_017476	CTG	2	6	1931	1936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385824842
16	NC_017476	TGC	2	6	1949	1954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385824842
17	NC_017476	CCA	2	6	1973	1978	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385824842
18	NC_017476	TTC	2	6	2006	2011	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385824842
19	NC_017476	TGTT	2	8	2156	2163	0 %	75 %	25 %	0 %	385824842
20	NC_017476	ATG	3	9	2232	2240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385824843
21	NC_017476	TCC	2	6	2302	2307	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385824843
22	NC_017476	TTG	2	6	2311	2316	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385824843
23	NC_017476	ATG	2	6	2320	2325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385824843
24	NC_017476	TGC	2	6	2329	2334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385824843
25	NC_017476	TGA	2	6	2378	2383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385824843
26	NC_017476	TTC	2	6	2394	2399	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385824843
27	NC_017476	AGT	2	6	2407	2412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385824843
28	NC_017476	CGG	2	6	2444	2449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385824843
29	NC_017476	AAT	2	6	2529	2534	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385824843
30	NC_017476	GGT	2	6	2583	2588	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385824843
31	NC_017476	CTG	2	6	2616	2621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385824843
32	NC_017476	GTT	2	6	2647	2652	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385824843
33	NC_017476	TGAC	2	8	2667	2674	25 %	25 %	25 %	25 %	385824843
34	NC_017476	AT	3	6	2749	2754	50 %	50 %	0 %	0 %	385824843
35	NC_017476	AACT	2	8	2837	2844	50 %	25 %	0 %	25 %	385824843
36	NC_017476	GAG	2	6	3035	3040	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385824843
37	NC_017476	GATCAA	2	12	3071	3082	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385824843
38	NC_017476	CAC	2	6	3101	3106	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385824843
39	NC_017476	TGAT	2	8	3135	3142	25 %	50 %	25 %	0 %	385824843
40	NC_017476	GTA	2	6	3153	3158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385824843
41	NC_017476	TCA	2	6	3277	3282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385824843
42	NC_017476	CTTTG	2	10	3387	3396	0 %	60 %	20 %	20 %	385824843
43	NC_017476	TCAT	2	8	3421	3428	25 %	50 %	0 %	25 %	385824843
44	NC_017476	TAGTT	2	10	3430	3439	20 %	60 %	20 %	0 %	385824843
45	NC_017476	CAT	2	6	3479	3484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385824843
46	NC_017476	CAT	2	6	3530	3535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385824843
47	NC_017476	GCA	2	6	3545	3550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385824843
48	NC_017476	ATC	2	6	3561	3566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385824843
49	NC_017476	CA	3	6	3575	3580	50 %	0 %	0 %	50 %	385824843
50	NC_017476	CAT	2	6	3590	3595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385824843
51	NC_017476	GTT	2	6	3614	3619	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385824843
52	NC_017476	CAG	2	6	3635	3640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385824843
53	NC_017476	GTT	2	6	3643	3648	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385824843
54	NC_017476	GCT	2	6	3707	3712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385824843
55	NC_017476	CAA	2	6	3815	3820	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385824843
56	NC_017476	CG	3	6	3843	3848	0 %	0 %	50 %	50 %	385824843
57	NC_017476	T	7	7	3886	3892	0 %	100 %	0 %	0 %	385824843
58	NC_017476	GTT	2	6	3896	3901	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385824843
59	NC_017476	GGCT	2	8	3985	3992	0 %	25 %	50 %	25 %	385824843
60	NC_017476	GTC	2	6	4009	4014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385824843
61	NC_017476	GGT	2	6	4181	4186	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385824843
62	NC_017476	TGAT	2	8	4197	4204	25 %	50 %	25 %	0 %	385824843
63	NC_017476	ACC	2	6	4230	4235	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385824843
64	NC_017476	CAGC	2	8	4274	4281	25 %	0 %	25 %	50 %	385824843
65	NC_017476	ATG	2	6	4295	4300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385824843
66	NC_017476	AATG	2	8	4316	4323	50 %	25 %	25 %	0 %	385824843
67	NC_017476	AAT	2	6	4362	4367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385824843
68	NC_017476	GGC	2	6	4377	4382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385824843
69	NC_017476	ACC	2	6	4430	4435	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385824844
70	NC_017476	GAC	2	6	4450	4455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385824844
71	NC_017476	GCA	2	6	4467	4472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385824844
72	NC_017476	TCA	2	6	4499	4504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385824844
73	NC_017476	T	6	6	4885	4890	0 %	100 %	0 %	0 %	385824845
74	NC_017476	TCG	2	6	5127	5132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385824846
75	NC_017476	TTCT	2	8	5150	5157	0 %	75 %	0 %	25 %	385824846
76	NC_017476	ATC	2	6	5195	5200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385824846
77	NC_017476	CGG	2	6	5231	5236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385824846
78	NC_017476	TTGC	2	8	5422	5429	0 %	50 %	25 %	25 %	385824847
79	NC_017476	T	7	7	5444	5450	0 %	100 %	0 %	0 %	385824847
80	NC_017476	T	6	6	5491	5496	0 %	100 %	0 %	0 %	385824847
81	NC_017476	CGG	2	6	5563	5568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385824847
82	NC_017476	TGGAT	2	10	5569	5578	20 %	40 %	40 %	0 %	385824847
83	NC_017476	T	6	6	5831	5836	0 %	100 %	0 %	0 %	385824847
84	NC_017476	GCT	2	6	5864	5869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385824847
85	NC_017476	TG	3	6	5964	5969	0 %	50 %	50 %	0 %	385824847
86	NC_017476	CAC	2	6	5986	5991	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385824847
87	NC_017476	CT	3	6	6039	6044	0 %	50 %	0 %	50 %	385824847
88	NC_017476	CT	3	6	6079	6084	0 %	50 %	0 %	50 %	385824847
89	NC_017476	CAC	2	6	6100	6105	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385824847
90	NC_017476	TG	3	6	6167	6172	0 %	50 %	50 %	0 %	385824847
91	NC_017476	CAA	2	6	6181	6186	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385824847
92	NC_017476	TGA	2	6	6240	6245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385824847
93	NC_017476	TGA	2	6	6253	6258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385824847
94	NC_017476	AGA	2	6	6289	6294	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385824847
95	NC_017476	TGG	2	6	6344	6349	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385824847
96	NC_017476	GTT	2	6	6406	6411	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385824848
97	NC_017476	GTT	2	6	6486	6491	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385824848
98	NC_017476	T	6	6	6594	6599	0 %	100 %	0 %	0 %	385824848
99	NC_017476	GCT	2	6	6669	6674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385824848
100	NC_017476	TCAGC	2	10	6681	6690	20 %	20 %	20 %	40 %	385824848
101	NC_017476	TTGGC	2	10	6731	6740	0 %	40 %	40 %	20 %	385824848
102	NC_017476	AAT	2	6	6786	6791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385824848
103	NC_017476	CTT	2	6	6946	6951	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385824848
104	NC_017476	CAAA	2	8	7008	7015	75 %	0 %	0 %	25 %	385824848
105	NC_017476	A	6	6	7013	7018	100 %	0 %	0 %	0 %	385824848
106	NC_017476	TAT	2	6	7027	7032	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385824848
107	NC_017476	T	6	6	7126	7131	0 %	100 %	0 %	0 %	385824848
108	NC_017476	GCC	2	6	7181	7186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385824848
109	NC_017476	CAT	3	9	7567	7575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385824849
110	NC_017476	TCA	2	6	7594	7599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385824849
111	NC_017476	CTT	2	6	7604	7609	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385824849
112	NC_017476	T	6	6	7608	7613	0 %	100 %	0 %	0 %	385824849
113	NC_017476	AAC	2	6	7657	7662	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385824849
114	NC_017476	GTT	2	6	7715	7720	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385824849
115	NC_017476	T	7	7	7729	7735	0 %	100 %	0 %	0 %	385824849
116	NC_017476	GCT	2	6	7736	7741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385824849
117	NC_017476	ATT	2	6	7804	7809	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385824849
118	NC_017476	TTA	2	6	7820	7825	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385824850
119	NC_017476	TGAT	2	8	7841	7848	25 %	50 %	25 %	0 %	385824850
120	NC_017476	TGC	2	6	7881	7886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385824850
121	NC_017476	GCA	2	6	7900	7905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385824850
122	NC_017476	GGT	2	6	8067	8072	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385824850
123	NC_017476	TTG	2	6	8129	8134	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385824850
124	NC_017476	T	6	6	8190	8195	0 %	100 %	0 %	0 %	385824850
125	NC_017476	TTA	2	6	8293	8298	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385824850
126	NC_017476	TGC	2	6	8425	8430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385824851
127	NC_017476	TCC	2	6	8442	8447	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385824851
128	NC_017476	GA	3	6	8450	8455	50 %	0 %	50 %	0 %	385824851
129	NC_017476	CTGC	2	8	8519	8526	0 %	25 %	25 %	50 %	385824851
130	NC_017476	ACCA	2	8	8532	8539	50 %	0 %	0 %	50 %	385824851
131	NC_017476	TTG	2	6	8571	8576	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385824851
132	NC_017476	GCG	2	6	8602	8607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385824851
133	NC_017476	GCT	2	6	8608	8613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385824851
134	NC_017476	TTA	2	6	8644	8649	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385824851
135	NC_017476	CAC	2	6	8677	8682	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385824851
136	NC_017476	ACC	2	6	8709	8714	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385824851
137	NC_017476	TTG	2	6	8776	8781	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385824851
138	NC_017476	GGC	2	6	8844	8849	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385824851
139	NC_017476	AAC	2	6	8883	8888	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385824851
140	NC_017476	GGAT	2	8	8934	8941	25 %	25 %	50 %	0 %	385824851
141	NC_017476	AAT	2	6	8946	8951	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385824851
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155	NC_017476	TGGTT	2	10	9484	9493	0 %	60 %	40 %	0 %	385824851
156	NC_017476	GTTT	2	8	9526	9533	0 %	75 %	25 %	0 %	385824851
157	NC_017476	ACT	2	6	9555	9560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385824851
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243	NC_017476	ACA	3	9	13931	13939	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385824853
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245	NC_017476	ATC	2	6	13997	14002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385824853
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251	NC_017476	AT	3	6	14294	14299	50 %	50 %	0 %	0 %	385824853
252	NC_017476	CAT	2	6	14308	14313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385824853
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255	NC_017476	CAG	2	6	14506	14511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385824854
256	NC_017476	CAC	2	6	14584	14589	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385824854
257	NC_017476	ACCA	2	8	14594	14601	50 %	0 %	0 %	50 %	385824854
258	NC_017476	GCG	2	6	14610	14615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385824854
259	NC_017476	ACC	2	6	14624	14629	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385824854
260	NC_017476	TTAT	2	8	14694	14701	25 %	75 %	0 %	0 %	385824855
261	NC_017476	TCAG	2	8	14726	14733	25 %	25 %	25 %	25 %	385824855
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263	NC_017476	TCA	2	6	14765	14770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385824855
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